Muzeul se află în clădirea fostului turn de apă, care are deja 119 ani. În timpul cutremurului din 1990, clădirea a fost grav avariată și a fost închisă zece ani. În 2000, muzeul și-a reluat activitatea, dar după doar doi ani a fost din nou închis pentru reconstrucție. Deschiderea sa recentă a fost programată cu ocazia sărbătoririi Zilei orașului Chișinău. Muzeul Istoriei Orașului Chișinău
În prezent, în muzeu funcționează o singură expoziție temporară, dedicată alimentării cu apă a Chișinăului. În viitor se intenționează deschiderea unei expoziții permanente, dedicate istoriei capitalei.
Turnul de apă a fost construit în 1892. Clădirea a fost proiectată de celebrul arhitect Bernardazzi.
Ca muzeu al orașului Chișinău, turnul a început să funcționeze în 1971.
Turnul în sine a pus bazele alimentării centralizate cu apă a orașului. Etajul superior reprezintă o suprastructură din lemn. Înălțimea construcției până la cornișa de coronament este de 22 de metri. Pereții portanți sunt realizați din piatră locală de scoică (calcar coquina, numit „kotsel”), cu includerea unor rânduri de zidărie de cărămidă. Grosimea pereților variază de la 2 metri la bază până la 0,6 m la etajele superioare.
În interiorul turnului s-a păstrat o scară metalică elicoidală, iar în timpul reconstrucției a fost montat un lift.
O perioadă, în clădirea turnului de apă a fost sediul Muzeului Istoric.
Un turn de apă identic a fost construit și la intersecția străzilor Vasile Alecsandri și Veronica Micle, dar până în zilele noastre nu s-a păstrat.
